O discente que ingressa no Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Medicina (Anatomia Patológica), da UFRJ, poderá ser orientado por até 3 docentes, permanentes ou colaboradores do Programa, podendo ter também um co-orientador.
Para a obtenção do título de Doutor o candidato deverá ter completado, no mínimo, 20 créditos de disciplinas obrigatórias e 10 créditos das disciplinas complementares (optativas), com um total mínimo de 450 horas, e ter defendido o exame de qualificação e uma Tese, com defesa pública diante de banca examinadora, como trabalho de conclusão do curso e ter pelo menos 1 artigo submetido para publicação ou já publicado até o dia da defesa.
O curso de Doutorado terá a duração de 48 (quarenta e oito) meses, podendo ser prorrogados por somente mais 12 (doze) meses, se devidamente justificado.
Os períodos letivos do Programa e os prazos de inscrição, desistência das disciplinas, entre outros, são estipulados pelo Conselho de Ensino para Graduados (CEPG), órgão deliberativo da estrutura superior da Universidade Federal do Rio de Janeiro, responsável pelas diretrizes didáticas e pedagógicas dos cursos de pós-graduação.